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circRNA研究汇总 | 20191007-1013

木禾 circRNA 2021-02-21

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欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献20篇,下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。


1、阿尔茨海默症患者大脑皮质中的环状RNA表达谱证明circRNA的强临床和病理学关联性

论文标题:An atlas of cortical circular RNA expression in Alzheimer disease brains demonstrates clinical and pathological associations.

杂       志: Nature Neuroscience

影响因子:21.126

通讯作者: Carlos Cruchaga教授(美国华盛顿大学医学院)


前期已有多项研究表明circRNA在大脑和神经系统中表达丰度高且独立其线性基因表达,提示circRNA在大脑发育和神经元兴奋中起重要调控作用。阿尔茨海默症(Alzheimer’s disease,AD)则是一种多因素引起、难治疗的不可逆神经退行性疾病。目前人们对AD的发病机制所知甚少,提高AD早期筛查和治疗能力非常紧迫,因此急需找到新的AD的诊断标记物和治疗靶标。美国华盛顿大学医学院Carlos Cruchaga教授带领的研究团队,利用生信息学技术对Knight ADRC研究中心和西奈山脑库(MSBB)的两个阿尔茨海默氏症RNA测序(RNA-seq)数据集进行定量和深度挖掘,结果显示circRNA表达水平变化与AD诊断,临床痴呆严重程度和神经病理学严重程度之间存在重要关联性,大多数circRNA-AD关联与其同源线性mRNA表达或脑细胞类型比例变化无关。还观察到与AD相关的circRNA与已知AD基因共表达关系。该研究结果凸显circRNA与AD的重要关联,强烈地提示circRNA或可成为AD的新型临床指标,为进一步研究circRNA在AD发病机理中的潜在作用提供了重要资源。

图注:AD密切相关的circRNA列表


2、环状RNA Foxo3的减少促进前列腺癌的进展和对多西紫杉醇的耐药性

论文标题:Reduction of circular RNA Foxo3 promotes prostate cancer progression and chemoresistance to docetaxel.

杂       志:  Cancer Letters

影响因子:6.508

通讯作者: 徐骏(复旦大学附属华东医院泌尿外科)


据报道,circFoxo3的失调与乳腺癌和非小细胞肺癌的进展有关。但是,关于circFoxo3在前列腺癌中的作用知之甚少,该研究对此进行了研究。在22个低级别前列腺癌样本,24个高级别前列腺癌样本和18个正常前列腺组织中分析了CircFoxo3的表达,发现与低级别前列腺癌和正常前列腺组织相比,CircFoxo3在高级别前列腺癌中的表达量显著减少。进一步研究表明,circFoxo3通过对Foxo3和EMT的抑制作用,实现对多西紫杉醇耐药性,提高前列腺癌细胞的存活,迁移,侵袭能力。沉默circFoxo3表达可促进前列腺癌细胞的生存,迁移,侵袭及对多西紫杉醇的化学耐药性,以及雄激素对前列腺癌生存能力的积极影响。前列腺荷瘤小鼠中过表达circfoxo3可增强小鼠对多西紫杉醇的化学敏感性并延长了小鼠的寿命,而siRNA干扰circFoxo3后促进了对多西紫杉醇的化学耐药性并导致荷瘤小鼠的寿命缩短。靶向circFoxo3 / Foxo3 / EMT可能为探索潜在的前列腺癌预后和治疗方法提供一种新的适用策略。


3、环状RNA hsa_circ_0016070通过促进PASMC增殖与肺动脉高压相关

论文标题:Circular RNA hsa_circ_0016070 Is Associated with Pulmonary Arterial Hypertension by Promoting PASMC Proliferation.

杂       志:Molecular Therapy-nucleic Acids

影响因子:5.919

通讯作者: Ran Wang和孙耕耘(安徽医科大学附属第一医院),曹超(宁波市第一医院)


肺动脉高压(PAH)指肺动脉压力升高超过一定界值的一种血流动力学和病理生理状态,可导致右心衰竭,可以是一种独立的疾病,也可以是并发症,还可以是综合征。非编码RNA在肺动脉高压的发病机理中起重要作用。在这项研究中,作者研究了hsa_circ_0016070,miR-942和CCND1在PAH中的作用。首先利用circRNA芯片筛选PAH中差异表达的circRNA,实时荧光定量PCR和Western blot分析检测不同组中miR-942和CCND1的表达。另外,还分析研究了miR-942对CCND1表达的影响以及hsa_circ_0016070对miR-942和CCND1表达的影响。此外,MTT分析和流式细胞仪检测hsa _circ_0016070对细胞增殖和细胞周期的影响。根据circRNA芯片分析的结果,确定hsa _circ_0016070与慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者的PAH风险有关。COPD(+)PAH(+)组中的miR-942水平远低于COPD(+)PAH(-)组,而COPD(+)PAH(+)组中的CCND1水平相比其在COPD(+)PAH(-)组更高。CCND1被鉴定为miR-942的候选靶基因,萤光素酶检测表明,野生型CCND1 3'UTR的萤光素酶活性被miR-942模拟物抑制。此外,hsa _circ_0016070减少了miR-942的表达并增强了CCND1的表达。hsa _circ_0016070明显增加了细胞活力并减少了G1 / G0期停滞的细胞数量。总之,该研究结果表明,hsa_circ_0016070可通过miR-942 / CCND1促进肺动脉平滑肌细胞(PASMC)的增殖且与PAH中的血管重塑有关。因此,has_circ_0016070可用作PAH诊断和治疗中的新型生物标志物。

图注:circRNA芯片检测结果显示hsa_circ_0016070在PAH的COPD患者中表达水平差异



参考文献列表:




1

测序数据再分析助成两篇重量级circRNA研究论文

2

造血细胞转录组图谱中细胞类型特异性新lincRNA和circRNA

3

circRNA研究汇总 | 20190930-1006

4

口腔鳞状细胞癌中circUHRF1促癌机制

5

circRNA研究汇总 | 20190923-0929

6

circFndc3b调控FUS/VEGF-A信号通路,促进心肌修复




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